為未來的農業、生物技術和生物醫學發展保護植物資源至關重要。以色列擁有一些最重要的全球遺傳資源，以及最先進的農業、遺傳和生物技術研究中心，因此必須保存其遺傳資產，以確保自己以及世界的經濟和科學未來。

以色列植物基因庫促進建立和維護基因庫的研究，在基因庫的運作、種子的保存和遺傳變異等方面和國內、國際進行合作。

以色列植物基因庫負責收集和保護以色列所有植物的野生種子，重點是可能具有未來農業經濟或社會文化潛力的野生植物。 近年來，基因庫已將其活動擴展到包括稀有野生，特有或瀕危植物（以色列國家生物多樣性計劃，2010年）。 基因庫旨在建立一個在以色列植物區系中發現的重要植物性狀的遺傳數據庫。 它還專門用于保護地方品種，這些地方品種是古代農作物的祖先，其中包含隨著時間推移而發展的特征（基因）的進化記錄。

植物基因庫包含用于種子保存和處理的獨特設施，用于按重量分離種子的設備，可控制溫度和濕度的干燥室，用于冷凍的儲藏室，實驗室，種子收集和處理系統（質量測試，發芽）以及繁殖系統。 基因庫的所有活動（數據收集，照片地理信息，清潔數據，包裝，發芽，田間生長，種子訂單和分發）都記錄在MySQL服務器數據庫中，該數據庫管理和計劃目標設置并監視正在進行的操作。該數據庫導入到植物基因庫的網站，為不同的受眾提供數據和訂購種子樣本。

建立了以色列植物物種的國家級收藏，以種子的形式保存，最大程度展現每個物種的遺傳多樣性。 在精確的條件下收集、處理和儲存種子，以確保其長期生存的能力?；驇斓难芯炕A設施向所有公共和私人研究機構開放，并且是唯一保留以色列所有野生植物的生物和遺傳多樣性的機構。

基因庫設施還在中長期內維護ARO的種植物收集和ARO研究人員的種子收集?；驇旌虯RO收集了大約2070個不同物種的30,000個樣本。這些樣品中約有15,000個是在以色列收集的，主要來自野生種群。

此外，還有來自152個國家的大量品種和商業品種。 收集的樣品包括ARO引進部門收集的樣品，該部門先于植物基因庫成立，其職責是識別和調查具有經濟農業價值以適應以色列商業化種植的不同品種。

作為國家生態保護工作的一部分，植物基因庫與許多負責保護國家生物多樣性和自然寶藏的國家機構建立了長期合作伙伴關系。

2007年，植物基因庫開始與以色列公園和自然管理局（IPNA）合作，旨在保護稀有和瀕危植物野生種群中代表性的遺傳多樣性樣本。該項目收集、處理和保護稀有物種的種子，以確保其長期的生存能力。植物基因庫還收集和繁殖種子以進行長期保存。 最近，植物基因庫和IPNA擴大了合作伙伴關系，以傳播瀕危植物物種，并將其重新引入其自然棲息地。

自2009年以來，以色列環境保護部一直支持植物基因庫計劃，以保護受損地區的植物遺傳多樣性。重點是人類活動和發展密集的地區，例如城市擴張和發展，道路建設，農業發展和周邊地區，處于危險中的沿海和 kurkar（沿海砂巖）山脊，包括僅在這些生態位中發現的具有獨特生態型的濕地。

植物基因庫已與不同國家的植物基因庫以及專注于生物多樣性研究和保護的國際機構建立并持續發展合作關系，例如國際生物多樣性組織和歐洲作物遺傳資源合作計劃（ECPGR：European Cooperative Programme for Crop Genetic Resources），這是一項致力于作物遺傳資源的歐洲計劃。

植物基因庫與Kew皇家植物園的千年種子庫（MSB：Millennium Seed Bank）有合作協議。 以色列植物基因庫向MSB提供種子樣品和壓制的植物標本，以備后用。種子共享基于法律協議和合作伙伴關系。 2013年，MSB簽署了一項共同資助協議，以收集全球主要糧食作物的野生親緣種。2016年，簽署了一項協議，共同為C4項目的植物收集提供資金。